对SARS冠状病毒蛋白质功能的有效识剐将有利于促进SARS传染病治疗药物的开发。应用基于支持向量机原理的SVMProt程序识别SARS冠状病毒蛋白质的功能，通过对SARS冠状病毒中2个已知功能的蛋白质功能的成功预测，说明SVMProt能够有效地应用于SARS冠状病毒蛋白质及其他种类蛋白质的功能预测。对SARS冠状病毒中至今仍未知其功能的蛋白质ORFl3的功能进行了预测，结果显示ORFl3是一种可能与DNA结合的核蛋白并兼有病毒体内结构蛋白的功能。